Organisasi kemahasiswaan Fakultas Pertanian Universitas Mulawarman menjadi wadah pengembangan kepemimpinan, minat dan bakat, penalaran, kerohanian, serta pengabdian mahasiswa. Organisasi terdiri atas lembaga tingkat fakultas dan himpunan mahasiswa di tiap program studi.
Lembaga Tingkat Fakultas
Dewan Perwakilan Mahasiswa (DPM)
- Jenis
- Lembaga legislatif mahasiswa
- Peran
- Menampung aspirasi, mengawasi kinerja organisasi eksekutif, dan mitra penyusunan kebijakan kemahasiswaan
- @dpmfapertaunmul
Badan Eksekutif Mahasiswa (BEM)
- Jenis
- Lembaga eksekutif mahasiswa
- Peran
- Pelaksana kegiatan kemahasiswaan: pengembangan minat bakat, kepemimpinan, dan pengabdian masyarakat
- @bemfapertaunmul
Lembaga Dakwah Mahasiswa (LDM)
- Jenis
- Lembaga kerohanian Islam
- Peran
- Wadah pembinaan spiritual dan keislaman mahasiswa
- @ldmal_alaa
Himpunan Mahasiswa Program Studi
HIMAGROTEK
- Jenis
- Himpunan Mahasiswa
- Program Studi
- Agroekoteknologi
- @himagrotek_unmul
HIMAGRIKOM
- Jenis
- Himpunan Mahasiswa
- Program Studi
- Agribisnis
- @himagrikom_unmul
HIMALOGISTA
- Jenis
- Himpunan Mahasiswa
- Program Studi
- Teknologi Hasil Pertanian
- @himalogista_unmul
HIMASTER
- Jenis
- Himpunan Mahasiswa
- Program Studi
- Peternakan
- @himaster_unmul
HIMAGISTATROP
- Jenis
- Himpunan Mahasiswa Pascasarjana
- Program Studi
- Magister Pertanian Tropika Basah
- @himapasca_fapertaunmul
HIMADIP
- Jenis
- Himpunan Mahasiswa Pascasarjana
- Program Studi
- Doktor Ilmu Pertanian
- @himadip.unmul